距离第二部后猫狗休战已经过去10年了，猫狗两家共同发明了一种监控系统，维持和平化解冲突。然而当一只精通技术的鹦鹉出现，利用自己的“黑客”技术入侵，并使用猫和狗才能听到的频率来操控它们，世界各地再度爆发猫狗大战！于是，一群没有经验的新手猫狗特工要用最原始的方式来恢复和平。

一股新黑暗势力威胁到小马谷，六位小伙伴紫悦、苹果嘉儿、云宝、碧琪、柔柔和珍奇离开小马国踏上难忘之旅，在旅途中他们结交新朋友，遇到刺激的挑战，必须通过友谊的魔力拯救自己的家园。