17岁的佃美奈是一位普通的女高中生，她一直憧憬着某一天能当上一位播音员。
　　有一天，美奈被露那电视台选为了特约高中生播音员，并可以与她的偶像：播音员甲州翠怜一起工作！这令她感到幸福得有些不切实际！！！
　　但是，她在一次主持体育节目的时候，突然卷入了宇宙人出现的事件之中！并且，也得知了她被赋予的重大使命…………

鲁路修本是帝国的王子，在母后遇害后，和失明的妹妹一起被流放到11区（原日本国）作为人质。在那里他们结识了日本王子朱雀，三人共同度过一段美好的童年时光。帝国最终全面攻陷了11区，鲁路修和妹妹的安宁生活再次被剥夺，朱雀和他们也分散了。
　　鲁路修和妹妹隐瞒身份，过着看似平凡的学生生活。然而鲁路修心中对于帝国的仇恨却未停止。他希望摧毁帝国，为妹妹营造一个可以快乐生活的世界。这一切随着神秘少女C.C的出现变得不再遥不可及。
　　此时朱雀也再次出现在他们的生活中，然而残酷的现实让童年的挚友难以重温童年往事。这里没有正义和邪恶，黑暗与光明，有的仅仅是艰难的抉择和难以预料的明天。

平凡的男生水原朋也（寺川爱美 配音）一直以来都过着波澜不惊的生活，殊不知，他平静的生活即将走到尽头。父亲再婚后，一个名为水原一香（长妻树里 配音）的少女成为了朋也没有血缘关系的姐姐，让朋也没有想到的是，面前这个看起来温文尔雅的女孩，在内心里居然是一个不折不扣的弟控。就这样，朋也和一香的“同居生活”正式开始了。
　　除了一香外，朋也的身边还聚集了一帮个性特异的女孩子们——外表人畜无害，实际上却腹黑无比的藤咲美奈（木户衣吹 配音）、金发巨乳个性奔放的万里奈（井上麻里奈 配音）、体力过人活泼可爱的早坂（南央美 配音），有了这些女孩子们的陪伴，朋也的生活会发生怎样翻天覆地的变化呢？

谷山麻衣（名冢佳织 配音）是个有预知和感应能力的高一女生，机遇巧合之下认识了长相英俊、颇为自恋的涉谷一也（泰勇气 配音），原来他是个专业的狩灵师，还是专门调查灵异事件事务所的所长，他身边有个叫林兴徐的助手。麻衣所在的学校出现了谣传，说旧校舍被灵所诅咒。涉谷一也受到校长委托，来到学校调查。同时被叫来的，还有巫女松崎绫子、和尚滝川法生、驱魔者约翰·布朗和灵媒师原真砂子。一行人在展开调查之时，发生了种种事故，这究竟是何种力量在作祟？
　　事件解决后，涉谷一也邀请麻衣加入他的涉谷心灵研究所（即SPR）打工。SPR接受各种委托，对各类灵异事件展开调查。麻衣和涉谷他们不仅仅用自身超能力解决问题，而且还会用现代科学解释。

莲川一也（佐佐木望 配音）是一个平凡的少年，和哥哥莲川一弘（井上和彦 配音）过着相依为命的生活。哥哥即将结婚了，可是，他的结婚对象竟然是一也的初恋，这让初涉爱河的一也备受打击，感到在家中毫无容身之处。
　　终于，一也升入了高中，虽然过程有一点坎坷，但是踏入私立绿都学院高中校门的一瞬间，他的内心还是有着小小的激动。一也入住了男生宿舍绿林寮，在这里，他结识了风度翩翩温柔体贴的宿舍长池田光流（岩田光央 配音）、总是绷着一副面孔但实际上非常温柔的手冢忍（关俊彦 配音）和看上去完全就是一个女生但实际上是男儿身的如月瞬（坂本千夏 配音）等人。

这是个人造的世界，一个充满不可思议的力量的地方。一群十四，五岁的孩子在灾难来临的时候，不经意却又无可避免的落如了这个神秘的空间内。
　　《无限的未知》是近期看的片子内唯一一部与众不同的TV版动画，透过一群孩子在无成人带领的情况下，生活在名位“利维亚斯”的宇宙船内，被外面的世界背叛，诬陷为恐怖份子后的几个月的逃亡生活。
　　当有人聚集的地方就会形成一个社会；当人群遭受灾难即会出现骚乱，暴动；当面临未知的命运时就会有不安，恐惧。所以当这些事落在一群孩子身上，表现的更加强烈。诱骗、隐瞒、强压、暴力都无法抑制越来越中的不按，当面对外面的强敌时可以安心的依靠利维亚斯神奇的力量，可面对那一张张同自己一样不安的脸时却无能为力。
　　在这样的状况下擦发现自己的力量多么渺小，并不是拼命努力就可以了， 再也无法像以前一样压抑着不满微笑对人了。所有的人都变得更敏感，如一根被绷得过紧的弦只要是一阵风就会被震断，响声震耳欲聋。
　　和一般的动画不同之处就在于，《无限的未知》并不仅仅是描写一部机械与战争的热血漫画，在这部片子里我们看到的更多的是当绝望充斥着整个利维亚斯内，每个平凡人的表现。并且编导用了一个比较特别的表现形式，那就是自始至终出现在利维亚斯内的神秘少女。一个开始感觉如rei般的女孩，一个单纯到近乎白纸的女孩，一个从未接触过外人完全不了解人心的女孩。在这个船舱内如若无人境地的走动，感受着没一个人的恐惧，悲伤和绝望。于是这个开始面无表情的女孩变得会笑、会哭、会忧伤、会愤怒，然后更加强大。
　　为什么要这样？！
　　为什么？！
　　好痛苦！好悲伤！
　　可是我不想死！！
　　我想活下去！！
　　所以利维亚斯有了更强大的力量，于是每次都能绝处逢生，因为想活下去的信念超越了所有的情感和障碍。
　　利维亚斯一个神秘的世界，利维亚斯人类科技的产物，利维亚斯如白纸般的少女，利维亚斯——无限的未知。

被称为木星蜥蜴的神秘敌人第一次袭击地球是在2195年，面对拥有压倒性力量的敌人，地球军束手无策，火星连同殖民地一起落入敌人手中。这就是“第一次火星会战”
　　一年之后，为了夺回火星，民间组织尼鲁加路重工以最新的科技造出新型战舰NADESICO号，召集来的船员包括以年轻的女舰长御统由利加为首，她青梅竹马的朋友，身兼厨师和机师的天河名人，其他船员虽然各有所长，但人格和来历都有一点问题。
　　在战斗变得白热化之际，一个重大的真相被揭发了，敌人原来是100年前被放逐到木星的地球人子孙。他们想得到能够令其运用来往行星间的瞬间移动技术，玻色子跳跃的火星遗迹。
　　跟木连的和谈以失败告终，为了争夺火星的遗迹，NADESICO、木连和尼鲁加路的三方混战开始了，到此为止，是地球跟木连战斗的历史，后来，地球和木连结盟，宇宙总算恢复和平，以上是TV版的剧情。

仓田纱南（小田静枝 配音）从小就进入剧团表演，以童星的身份出道，人气十分了得。可是，即使是这样的孩子也有着数不清的烦恼。班上名为羽山秋人（中崎达也 配音）的男生带头反抗老师，使得班级陷入混乱之中，令纱南十分头痛，然而，当纱南得知秋人悲惨的身世和糟糕的家庭状况之后，决心依靠自己的力量来治愈秋人。
　　佐佐木刚（三泽真弓 配音）是纱南和秋人的朋友，善良的刚不幸遭遇了家庭破裂的悲剧而遭到同学们的嘲笑，就在此时，善良的杉田亚矢（菊地晶子 配音）站了出来，不仅袒护了刚，跟做出了惊人的告白。在不知不觉中，纱南已经深深喜欢上了秋人，然而，当她意识到自己的感情之时，却得知秋人已经开始了和好友松井风花（生驹治美 配音）的交往。