这是，人类与超越人智的存在之间的诀别与共存的故事。社会上的大部分都交由名为hIE的人型机器人管理的世界。17岁的少年·远藤新人，某天与一台人型机器人·蕾西亚相遇，并与之缔结了主从契约。外表与人类一模一样的“那个物体”，是具备震惊世界性能的超高性能AI所诞生出来的，超越人智的五台人型机器人“人类未到产物”之一——。
　　五台机体各自拥有自身的意义，为了得到对方的性能而开战。
　　仅仅只能旁观这场战斗的大人们，与接近这一存在、试图建立新的关系的少年们。他们寻求着通向未来的选择，以及人类与物体之间关系的答案——。
　　过度进化的机械，与人类世界的联系是什么？
　　在过于便利的这个时代，什么是重要的，什么是必要的，新人通过与远优于人类的人型机器人·蕾西亚的相遇，寻求着通向未来的选择，以及人类与物体之间关系的答案——。

运动万能、拥有正义感，在班上最受欢迎的美墨莎莎。成绩优秀，永远是班上的第一名，但其实有点天真的雪城乃香，两人同是就读菲诺奈学院女子中学部二年级的学生。某一天，莎莎和乃香各自遇见了不可思议的神奇生物美波和米波，他们由于故乡光之园遭到邪恶的攻击，因而逃到虹之园来。
　　然后，莎莎和乃香被美波和米波赋予神奇的力量，携手变身成光之美少女“Pretty Cure”。
　　性格和兴趣都完全相反的两个人将同心协力，和来自闇之领域的邪恶敌人展开战斗。